De forma a cumprir os objectivos do Fórum Cidadania e Território, tal como definidos na sua Carta de Princípios, e corresponder aos interesses e competências dos seus membros, foram constituídos, até ao momento os seguintes grupos de trabalho. Outros poderão vir a ser criados, em função da evolução do Fórum e das áreas de interesse dos respectivos membros.